肿瘤内科成立于2003年，2017年起人才引进沙晓锋肿瘤专家团队；2018年通过江苏省“癌痛规范化病房”评审认证，同步开设肿瘤导管专科门诊；2019年起开始筹备建设放疗病房，同年创建成为淮安市临床重点专科建设单位；2020年3月瓦里安直线加速器开始投入使用，放疗病房正式启动；2023年8月搬迁至新院区，11月创建为淮安市临床重点专科；2024年筹备创建国家级肿瘤营养示范病房及安宁疗护病房。
肿瘤科是“洪泽区肿瘤诊治质量控制中心”、“淮安市医学会肿瘤病学专业委员会”副主委单位。现有医技护人员32人，其中高级职称3人，中级职称6人。与江苏省肿瘤医院建立紧密型医联体合作模式，成立江苏省肿瘤医院内科专家团队名医工作室、放疗科专家团队名医工作室。
拥有瓦里安直线加速器、飞利浦大孔径CT、微波热疗机等先进设备，能够独立完成并常规开展肿瘤患者的各项常规及个体化治疗。成功开展食管癌放疗联合热疗新项目、乳腺癌大分割放疗、微波热疗联合个体化抗肿瘤方案治疗恶性腹水等新项目新技术十余项，获院内重大项目一项、市级新技术新项目二等奖两项。
